La misión de Fecomtur es contribuir al desarrollo económico y social sustentable del país, con un enfoque especial en la región del Biobío, mejorando la calidad de vida de las personas. Proporcionando herramientas para el desarrollo de los comerciantes asociados a las Cámaras de Comercio del Biobío, mediante capacitación en gestión y tecnología. Además, se compromete a representar a sus asociados ante autoridades y la comunidad, promoviendo un trabajo conjunto a través de alianzas público-privadas y convenios de colaboración.